Das Besondere am Dekanat St. Johann ist, dass alle hier tätigen Priester einer Ordensgemeinschaft angehören: Das Stift Wilhering ist über Jahrhunderte im Dekanat tätig. Das Stift Schlägl hat in den letzten Jahren Aufgaben in der Seelsorge übernommen.
Der Zisterzienserorden entstand als benediktinischer Reformzweig im 12. Jahrhundert. Besonders wichtig für die Entwicklung des Ordens war Bernhard von Clairvaux.
Das Kloster in Aigen-Schlägl entstand in der Nachfolge eines erloschenen Zisterzienserklosters. Es ist in den Jakobsweg Oberes Mühlviertel und in den Rupertiweg eingebunden. Zudem betreibt es die Stiftsbrauerei Schlägl.